Окончил педиатрический факультет второго Московского медицинского института в 1989 году, прошел обучение в ординатуре по детской хирургии на базе Детской клинической больницы № 13 им. Н.Ф. Филатова в 1989-1991 годах.
С сентября 1991 по март 2000 года работал врачом-хирургом отделения трансплантации почки РДКБ Минздрава России. В 1999 году прошел стажировку в Hopital Necker des Enfants Malades в Париже. Под руководством академика В.И. Шумакова защитил диссертации, в 1997 году кандидатскую «Пересадка почки у детей», в 2003 году докторскую «Послеоперационное лечение реперфузионного повреждения трансплантированной почки: новый взгляд на патогенез реперфузионной травмы». Звание профессора по специальности «трансплантология и искусственные органы» присвоено 16.01.2009.
С марта 2000 по сентябрь 2019 года заведовал отделением трансплантации почки ФГБНУ «РНЦХ имени академика Б.В. Петровского», где начал программу трансплантации почки детям, выполнил впервые в России успешные трансплантации панкреатодуоденального комплекса, тонкой кишки от посмертного донора.
С ноября 2019 по май 2021 возглавлял отдел трансплантации органов ФГАУ НМИЦ здоровья детей Минздрава России. С мая 2021 руководит программой подготовки к трансплантации и посттрансплантационного медицинского сопровождения в ООО «ОЛЛА-МЕД». В кадровом резерве Федерального центра медицины катастроф МЗ РФ с февраля 2025.
Под руководством Каабака М.М. созданы и продолжают функционировать программы лечения пациентов с тяжелыми заболеваниями:
программа трансплантации почки взрослым и детям ФГБНУ РНЦХ им акад Б.В.Петровского.
программа трансплантации почки ФГАУ НМИЦ здоровья детей
Программы трансплантации органов, созданные под руководством Каабака М.М., позволяют достигать успеха в лечении категорий пациентов, ранее считавшихся неоперабельными или безнадежными, не только за счет уникальных медицинских технологий, но и продвинутых коммуникативных практик при общении с пациентами, их родственниками, и медицинским персоналом, разработанных и внедренных в практику совместно с философским факультетом МГУ ими М.В. Ломоносова.
С 2009 по 2016 год под руководством Каабака М.М. организованы и проведены 7 ежегодных школ по детской трансплантации для врачей, вовлеченных в подготовку детей к трансплантации и их медицинское сопровождение после операции:
Москва 2009 год
Санкт-Петербург 2010 год
Истра 2011 год
Суздаль 2013 год
Петергоф 2014 год
Сочи 2015
Завидово 2016 год
В качестве лекторов в работе школы привлекались ведущие мировые специалисты.
Разработка программного кода и информационное наполнение базы данных: регистр пациентов с пересаженными органами https://baza.pochka.org/rnch_net_prod
Модератор секции «Актуальные вопросы трансплантации почки у детей» «Трансплантация почки в 21 веке. Междисциплинарный подход к лечению терминальной ХПН» в онлайн-формате 20 ноября 2020 года
Модератор симпозиума по трансплантации почки, юбилейная конференция 75 лет институту им Сызганова, Алматы, 30 сентября 2021 года
Член организационного комитета XIX РОССИЙСКИЙ КРОНГРЕСС «Инновационные технологии в педиатрии и детской хирургии» 20-21 октября 2020 года
Глава «трансплантация почки» в монографии «энциклопедия детской торакоабдоминальной онкохирургии» под редакцией А.Б.Рябова, М.И.Давыдова, Москва 2020
Модератор пленарного заседания Всероссийской научно-практической конференции Totum-Verum 2025, Москва-Санкт-Петербург-Самара, 21 октября 2025
Модератор Круглого стола «Медицинская антропология в помощь клиницисту: видеть больше, чем диагноз» в рамках XIII Международного междисциплинарного симпозиума «Медицинская антропология: наука, образование, практика», ИЭА РАН, Москва, 26 ноября 2025.